Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Ab1P01921 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Ab1P01921 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms