Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01812 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01812 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01812 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01812 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01812 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01812 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01812 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01812 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01812 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01812 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01812 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01812 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01812 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms