Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01792 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01792 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01792 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01792 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01792 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01792 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01792 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01792 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01792 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01792 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01792 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01792 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01792 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms