Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01747 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01747 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01747 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01747 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01747 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01747 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01747 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01747 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01747 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01747 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01747 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01747 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01747 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01747 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01747 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01747 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms