Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01727 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01727 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01727 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01727 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01727 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01727 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01727 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01727 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01727 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01727 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01727 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01727 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01727 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01727 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01727 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01727 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01727 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms