Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01658 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01658 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01658 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01658 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01658 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01658 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01658 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01658 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01658 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01658 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01658 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01658 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01658 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01658 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01658 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01658 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01658 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01658 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01658 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01658 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms