Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odc1P00860 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odc1P00860 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Odc1P00860 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms