Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mtatp6P00848 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mtatp6P00848 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mtatp6P00848 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms