Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vti1aO89116 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vti1aO89116 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vti1aO89116 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms