Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CopeO89079 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CopeO89079 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CopeO89079 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CopeO89079 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CopeO89079 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CopeO89079 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopeO89079 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CopeO89079 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopeO89079 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopeO89079 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopeO89079 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopeO89079 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopeO89079 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopeO89079 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopeO89079 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopeO89079 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopeO89079 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms