Protein–RNA interactions for Protein: O89017

Lgmn, Legumain, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgmnO89017 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgmnO89017 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgmnO89017 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgmnO89017 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgmnO89017 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LgmnO89017 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgmnO89017 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgmnO89017 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgmnO89017 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgmnO89017 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgmnO89017 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgmnO89017 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgmnO89017 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LgmnO89017 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgmnO89017 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgmnO89017 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgmnO89017 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgmnO89017 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgmnO89017 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms