Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CcnkO88874 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CcnkO88874 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcnkO88874 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CcnkO88874 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CcnkO88874 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CcnkO88874 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CcnkO88874 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms