Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcxO88809 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DcxO88809 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DcxO88809 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DcxO88809 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DcxO88809 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DcxO88809 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DcxO88809 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DcxO88809 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DcxO88809 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DcxO88809 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DcxO88809 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DcxO88809 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DcxO88809 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DcxO88809 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DcxO88809 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DcxO88809 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DcxO88809 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DcxO88809 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DcxO88809 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DcxO88809 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms