Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tom1O88746 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tom1O88746 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tom1O88746 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tom1O88746 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tom1O88746 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tom1O88746 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tom1O88746 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tom1O88746 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tom1O88746 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tom1O88746 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms