Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClppO88696 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClppO88696 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClppO88696 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClppO88696 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClppO88696 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClppO88696 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClppO88696 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClppO88696 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClppO88696 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClppO88696 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClppO88696 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClppO88696 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClppO88696 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClppO88696 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClppO88696 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ClppO88696 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClppO88696 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClppO88696 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClppO88696 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClppO88696 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClppO88696 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClppO88696 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClppO88696 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClppO88696 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClppO88696 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms