Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pak1O88643 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pak1O88643 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pak1O88643 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pak1O88643 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pak1O88643 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pak1O88643 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pak1O88643 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms