Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng2O88602 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacng2O88602 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacng2O88602 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacng2O88602 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacng2O88602 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms