Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn2O88552 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn2O88552 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn2O88552 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn2O88552 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn2O88552 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn2O88552 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn2O88552 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn2O88552 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn2O88552 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn2O88552 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn2O88552 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn2O88552 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms