Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnt1O88346 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tnnt1O88346 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnnt1O88346 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnt1O88346 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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