Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nid2O88322 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nid2O88322 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nid2O88322 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nid2O88322 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nid2O88322 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nid2O88322 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nid2O88322 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nid2O88322 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nid2O88322 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Nid2O88322 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nid2O88322 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nid2O88322 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nid2O88322 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nid2O88322 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nid2O88322 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nid2O88322 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nid2O88322 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nid2O88322 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nid2O88322 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nid2O88322 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nid2O88322 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nid2O88322 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nid2O88322 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nid2O88322 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Nid2O88322 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nid2O88322 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms