Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10226O88253 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10226O88253 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms