Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1O70583 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1O70583 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mid1O70583 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mid1O70583 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mid1O70583 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1O70583 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mid1O70583 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mid1O70583 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms