Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xirp1O70373 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xirp1O70373 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xirp1O70373 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms