Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmx1O70218 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmx1O70218 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmx1O70218 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms