Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd70O55237 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd70O55237 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd70O55237 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd70O55237 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd70O55237 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd70O55237 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd70O55237 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd70O55237 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd70O55237 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms