Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad51dO55230 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad51dO55230 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad51dO55230 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms