Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChadO55226 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChadO55226 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChadO55226 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChadO55226 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ChadO55226 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChadO55226 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChadO55226 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChadO55226 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChadO55226 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChadO55226 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChadO55226 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChadO55226 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChadO55226 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChadO55226 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChadO55226 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChadO55226 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChadO55226 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185 ms