Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx4O55187 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx4O55187 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx4O55187 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms