Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap2O55126 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap2O55126 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms