Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PrxO55103 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PrxO55103 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PrxO55103 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrxO55103 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrxO55103 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrxO55103 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrxO55103 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrxO55103 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrxO55103 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrxO55103 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrxO55103 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrxO55103 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrxO55103 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrxO55103 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrxO55103 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrxO55103 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrxO55103 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrxO55103 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PrxO55103 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrxO55103 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrxO55103 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrxO55103 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrxO55103 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PrxO55103 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PrxO55103 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrxO55103 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PrxO55103 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PrxO55103 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PrxO55103 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PrxO55103 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PrxO55103 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PrxO55103 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PrxO55103 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrxO55103 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrxO55103 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PrxO55103 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrxO55103 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrxO55103 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PrxO55103 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrxO55103 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrxO55103 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms