Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bnip3O55003 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bnip3O55003 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bnip3O55003 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bnip3O55003 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms