Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbieO54910 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbieO54910 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms