Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a2O54833 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csnk2a2O54833 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csnk2a2O54833 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms