Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdc4O35988 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdc4O35988 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms