Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf18O35714 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf18O35714 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms