Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edil3O35474 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edil3O35474 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edil3O35474 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edil3O35474 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms