Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppef2O35385 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppef2O35385 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppef2O35385 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms