Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NmiO35309 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NmiO35309 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NmiO35309 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NmiO35309 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NmiO35309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmiO35309 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmiO35309 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmiO35309 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmiO35309 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmiO35309 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmiO35309 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NmiO35309 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmiO35309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmiO35309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmiO35309 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmiO35309 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NmiO35309 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NmiO35309 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NmiO35309 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NmiO35309 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NmiO35309 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmiO35309 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NmiO35309 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NmiO35309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NmiO35309 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmiO35309 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmiO35309 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NmiO35309 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NmiO35309 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NmiO35309 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NmiO35309 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms