Protein–RNA interactions for Protein: O35257

Prl6a1, Prolactin-6A1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl6a1O35257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prl6a1O35257 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl6a1O35257 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl6a1O35257 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms