Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pkd2O35245 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pkd2O35245 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms