Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Polr1aO35134 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Polr1aO35134 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Polr1aO35134 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms