Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3cO35066 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms