Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snap23O09044 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snap23O09044 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snap23O09044 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snap23O09044 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snap23O09044 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snap23O09044 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Snap23O09044 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snap23O09044 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snap23O09044 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snap23O09044 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snap23O09044 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snap23O09044 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snap23O09044 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snap23O09044 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snap23O09044 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms