Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyth3O08967 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms