Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MttpO08601 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MttpO08601 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MttpO08601 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MttpO08601 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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MttpO08601 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MttpO08601 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MttpO08601 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MttpO08601 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MttpO08601 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MttpO08601 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MttpO08601 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MttpO08601 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MttpO08601 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MttpO08601 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MttpO08601 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MttpO08601 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MttpO08601 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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MttpO08601 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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MttpO08601 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MttpO08601 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MttpO08601 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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