Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MsmbO08540 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsmbO08540 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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