Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn2O08529 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn2O08529 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn2O08529 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms