Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc191J3QQ27 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms