Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5294J3QP53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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