Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm19965J3QNY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm19965J3QNY8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm19965J3QNY8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms